首先保鲜冷库在贮藏瓜果入库前，应先消毒及制冷，在瓜果入库前5.6天，用选用0.1mg/kg克菌灵喷洒来消毒，保持瓜果冷库内卫生清洁，没有杂菌。启动瓜果冷库库内制冷系统，将保鲜冷库温度调控在8-12℃，然后根据瓜果品种特性，1周内降至最佳温度。
瓜果入保鲜冷库储存之前，要先让瓜果预冷。预冷可以在采摘后堆放在地里，直接利用夜里低温预冷，在早晨温度回升之前存入冷库贮藏。瓜果入保鲜冷库时在一周内，利用冷库制冷机系统循环空气，借用热传导和蒸发潜热冷却瓜果，让瓜果本身与冷库温度一样。
瓜果冷库的相对温度3~5℃，相对湿度80％左右，最低库温可控制在0-3℃。0-8℃的瓜果冷藏库的管理注意要点:针对瓜果冷库贮藏及管理要点简述
1、瓜果冷库贮藏的相对温为5-6℃，尤其是瓜果入保鲜冷库贮藏初期，应根据渐渐降温后，再调整为正常贮藏，最大限度的减少瓜果的生理病害，提高瓜果的储存质量。夏季或秋季从保鲜冷库内取出瓜果时，瓜果表面会容易凝结水珠，出保鲜冷库后在货架的时间很短，所以瓜果出保鲜前需要慢慢升温，让瓜果本身温度慢慢升高到合适的温度再出库，这样非常有利于保证瓜果的质量和延长货架时间。
2、瓜果冷库贮藏的相对湿度为80-85％，由于制冷系统工作蒸发管会经常不断地结附冰霜，再又不断地将蒸发管上的冰霜冲走，再就是根据建筑物多用水泥材料，导致保鲜冷库内湿度降低，这样不符合瓜果对湿度的要求，在瓜果贮藏期可以可以在地面洒水或是铺湿草帘保持保鲜冷库内合适的湿度。
3、瓜果冷库内，瓜果在储存过程中会通过呼吸作用放出co2和乙烯等其他刺激性气体，当这些气体达到一定浓度后，会导致瓜果果实的后期成熟衰老，瓜果品质变差，无法达到长期储存。所以瓜果冷库必须通风换气。通风换气时间最好是在自然温度较低的早晨，同时开启自动喷雾器，随冷风将细微水雾送入瓜果保鲜库内，效果更加理想。